高校人事代理和雇员制是两种不同的招聘管理方式，有以下区别：

1. 雇员制：指高校根据财政法规，通过公开招聘或委托中介机构招聘职工，具有正式工作性质，签订合同并缴纳社会保险，享受公共福利和福利待遇。

2.人事代理制：指高校聘用中介公司或临时劳务公司，由其向高校推荐人员，聘用期限不同于雇员制，一般在3个月到1年之间，并不属于高校工作人员行列，不享受公共福利，福利待遇低于正式工。

总之，雇员制招募的职员为高校正式职工，享受相应的福利和社会保险，而人事代理制只是短期解决高峰期的人手短缺问题，因此招聘的人员只是临时工作人员，没有与雇员制相同的福利待遇。