浙江中医药大学实行学分制收费。学费按专业学费和学分学费两部分计收。
中医学、临床医学、口腔医学、预防医学、针灸推拿学专业学费每学年3325元，中药学、药学、药物制剂、中草药栽培与鉴定、医学检验技术、康复治疗学、卫生检验与检疫、听力与言语康复学、医学信息工程、计算机科学与技术、生物工程、护理学专业学费每学年2500元，英语、市场营销、公共事业管理、生物科学专业学费每学年1800元。所有专业学分学费均为每学分75元。收费方式采用预收制，在每学年第一学期开学时，中医学、临床医学、口腔医学、预防医学、针灸推拿学专业按6325元预缴，中药学、药学、药物制剂、中草药栽培与鉴定、医学检验技术、康复治疗学、卫生检验与检疫、听力与言语康复学、医学信息工程、计算机科学与技术、生物工程、护理学专业按5500元预缴，英语、市场营销、公共事业管理、生物科学专业按4800元预缴。该学年结束时，计算出每生的专业学费和选课学分学费的总额，于下学年开学初结清。以上收费标准若与省物价批文不符，则以物价批文为准。
