黔南民族医学高等专科学校新校区目前开设临床医学、护理、药学、中药、中药制药技术、医学检验技术、医学影像技术、口腔医学技术、药品经营与管理等14个专业。

该学校注重专业建设，承担了教育部教学改革项目1个，国家财政部重点支持专业2个，省级特色专业2个，省级精品课程3门，省级实验室4个。此外，学校还与北京大学医学部、广州中医药大学、台湾中山医学大学等10余所一流医学院校建立了友好合作关系。