两者从字面翻译虽然都是在同一所学校

但个人认为二者还是有区别的

at the same school一般指在同一所学校（就读），主体是指学生

而in the same school一般指在同一所学校里面，主体不一定是指学生，可以是身处学校里面的任何人，工作人员，家长，或到学校办事的人，也或者是指学校的各种事或物，只要他/它的位置在学校里面。