杭州惠灵顿国际学校是一所昂贵的学校，学费取决于学生就读的年级和课程。截至2021年，学费范围从18.7万元（小学）到39.8万元（高中），学费包括学杂费和住宿费。课外活动、书本、制服、校外活动所需费用等没有在学费中包含。

为让更多国际学生有机会进入学校，杭州惠灵顿国际学校提供奖学金计划，减免学费费用。奖学金按学生的成绩、社会贡献、特殊技能和金融状况等评定。